클러스터 제작에 사용할 수 있는 운영체제의 종류는 제법 많다. 심지어 마이크로소프트의 Windows NT 계열의 운영체제를 이용해서도 할 수 있다. 하지만 그에 따른 막대한 비용을 들여야 한다. 여기서는 운영체제로 Debian GNU/Linux를 사용했다. GNU/Linux의 설치에 대해서 자세히 설명하는 것은 이 문서의 범주를 넘어서므로 생략하겠다.
각 노드는 Debian GNU/Linux의 base system을 설치했으며 설치 Method는 network을 이용했다. 사용 가능한 할당된 IP가 하나였기 때문에 각 노드에 운영체제를 설치할때마다 랜선을 옮겨 꼽으면서 동일 IP로 설정해 설치한 후 IP정보를 변경했다. 이러한 번거로움이 싫다면 CD-ROM을 연결해서 CD로 설치하는 것도 좋은 선택일 것이다. 난 CD-ROM을 달아봐야 그다지 쓸일이 없다는 판단에 빼버리고 플로피를 이용해서 커널과 하드웨어 모듈만 설치한 후에 나머지는 network을 통해서 설치했다.
메인 노드에 랜카드를 두개 설치해야 한다는 사실을 제외하면 각 노드의 하드웨어 구성은 모두 동일하다.